Dein Grafikproblem ist ein wohlbekanntes. So ähnlich hab ich auch mal herumexperimentiert, nur hatte ich damals noch keinen Internetzugang und konnte in keinem Forum fragen, ganz davon abgesehen, daß es dieses schöne Forum noch lange nicht gab ...
Für mich scheint das Hauptproblem in der verwendeten Palette zu liegen, wenn ALLE Einheiten mit dem Hintergrund in Civ2 erscheinen.
Betrifft es aber nur deine kopierten und eingefügten Einheiten, ist wohl etwas von dem was Bernd sagt, der Fall. Probiere daher auf jeden Fall, was Bernd dir rät.
Falls es sich aber um das Palettenproblem handelt, versuche mal die geänderte Datei zu "exportieren" statt zu "speichern". Dort sollte dann eigentlich in CorelPhotoPaint die Transparenz ausgeschaltet werden können und soweit ich weiß, gibt es dort auch die Möglichkeit die Palette zu wählen (ich bin mir aber nicht sicher, denn seit ich Photoshop habe, nutze ich PhotoPaint kaum noch.)